Medzi nevýhody tejto hry patria nedomyslené funkcie obchodovania, nemožnosť bojovať jednotlivým užívateľom medzi sebou, hľadanie digitálnych zvieratiek bez naznačenia smeru či veľká spotreba batérie.
A to je len hŕstka problémov, kvôli ktorým sú niektorí užívatelia sklamaní. Dizajnérka a fanynka hry Pokémon GO – Wendy Borg – sa rozhodla tvorcom ukázať, ako by mohol vyzerať redesign UI Pokémon GO.
